Introducción: Enterococcus es un patógeno relevante relacionado a infecciones asociadas a la asistencia sanitaria (IAAS) a nivel mundial, favorecido por su resistencia a la mayoría de los antimicrobianos. Enterococcus resistente a vancomicina (ERV) constituye  un patógeno emergente desde 1990 que demanda una vigilancia sistemática para su control. Objetivos: Determinar los perfiles de resistencia antimicrobiana, y sus bases genéticas en EVR aislados en Cuba, su virulencia, linajes genéticos y su relación filogenética.Materiales y métodos: se caracterizaron, cinco cepas emergentes en Cuba de Enterococcus resistente a glicopéptidos procedente de cuatro provincias del país durante el período 2011 a 2013.  Se evaluó la susceptibilidad a 13 antimicrobianos y se determinaron diferentes genes de resistencia para glicopéptidos (vancomicina y teicolplanina, aminoglucósidos, macrólidos, tetraciclina y genes de virulencia  mediante la técnica de PCR.  Las  mutaciones gyrA, parC  en aislamientos resistentes a fluoroquinolonas  y las secuencias multilocus (ST) se evaluaron por secuenciación de ADN. Resultados: La resistencia glicopeptídica obedeció al gen vanA detectado en dos E. faecalis y tres E. faecium causantes de septicemia. No se detectó resistencia a linezolida. Todas las cepas fueron resistentes a gentamicina asociada a la enzima aac(6’)-aph(2”). La resistencia a levofloxacina resultó muy frecuente obedeciendo a mutaciones en los genes gyrA y parC.  E. faecalis fue más virulento que E faecium y perteneció al complejo clonal (CC)87 mientras que dos E. faecium pertenecieron al CC17 y otro correspondió a la nueva ST1349. Conclusiones: ERV persiste circulando en Cuba con multidrogorresistencia causando infección invasiva. La linezolida se corrobora como droga de elección. Para comprender mejor  la epidemiología  del ERV y sus orígenes, es imprescindible perfeccionar la vigilancia y desarrollar nuevos estudios de epidemiología  molecular.